สำนักศาสนศึกษาวัดพระธาตุช่อแฮ พระอารามหลวง จังหวัดแพร่ มีหน้าที่รับผิดชอบดังต่อไปนี้

• ข้อมูลการศึกษาทั่วไป
• งานห้องสมุด
• ทะเบียนประวัตินักเรียน
• การเรียนการสอนด้านนักธรรม
• การเรียนการสอนด้านบาลี
• การเรียนการสอนด้านธรรมศึกษา
• เอกสาร ตำรา นักธรรม, บาลี, ธรรมศึกษา
• งานสถิติข้อมูล
• งานปกครองสภาสามเณร
• งานอบรมส่งเสริมคุณธรรมจริยธรรม
• งานพัสดุครุภัณฑ์สำนักศาสนศึกษาฯ
• ทะเบียนหนังสือรับ-หนังสือส่ง
• งานด้านพระสอนศีลธรรมในโรงเรียน
• งานแหล่งเรียนรู้ด้านการศึกษา ศาสนา ศิลปวัฒนธรรม